Das Stiftungsbüro steht unter der Leitung eines Geschäftsführers und setzt sich aus den im Folgenden genannten Mitarbeitern zusammen. Gemeinsam bilden sie das Stiftungsteam.
Fachleute zahlreicher Gewerke unterstützen das Team anlass- und projektbezogen.
Die Arbeit der Stiftung Kirchenburgen baut auf dem knapp zehnjährigen Wirken des Projektbüros Leitstelle Kirchenburgen auf und entwickelt dieses entscheidend weiter.